La Vicerrectoría Pastoral es la instancia de Animación y Formación de los distintos integrantes de la comunidad escolar, la fe católica, la vida eclesial y su compromiso con la sociedad. El vicerrector es el integrante del equipo directivo nombrado por el sostenedor y dialogado con el rector. Responsable de implementar el proyecto pastoral del centro educativo de acuerdo a las directrices emanadas desde el encargado provincial de pastoral y de rectoría. Junto a su equipo, gestiona, instancias de promisión, evangelización y celebración de la fe en Jesucristo, la formación de comunidades y experiencias de desarrollo integral, en coordinación con las demás instancias formativas del liceo.